学校自上世纪八十年代起就与港澳台地区高校和机构建立和保持友好合作关系。目前与香港大学、香港中文大学、香港理工大学、澳门科技大学、台湾台北医学大学、义守大学、中山医学大学、嘉南药理大学、台北牙医师公会等高校和机构保持长期稳定的交流合作关系，在校际交流、医学人才培养、优质教育资源引进、学生交流等领域开展了一系列富有成效的合作，为推动内地与港澳台地区人文教育交流合作，促进内地与港澳台地区融合发展做出了积极贡献。
合作院校
香港理工大学 The Hong Kong Polytechnic University
香港中文大学 The Chinese University of Hong Kong
香港大学李嘉诚医学院 Li Ka Shing Faculty of Medicine, The Universityof Hong Kong
澳门科技大学 Macau University of Science and Technology
台北医学大学 Taipei Medical University
义守大学 I-Shou University
嘉南药理科技大学 Chia Nan University of Pharmacy & Science
台湾牙医师公会 Taipei Dental Association
中山医学大学 Chung Shan Medical University
阳明交通大学牙学院 National Yang-Ming Chiao Tung University
台湾大学牙学院 Faculty of Dentistry, Nation Tai Wan University
